وی به تقوا و ورع و دوری از گناه و شبهات معروف است. از وی نمونههای بسیاری در این مورد در کتب تراجم و طبقات نقل شده است.
طلق بن وهب طاحی میگوید: بر محمد بن سیرین وارد شدم در حالی که از بیماری رنج میبردم پس به من گفت: پیش فلانی برو که او نسبت به پزشکی آگاهی خوبی دارد؛ سپس گفت: اما نه، پیش فلانی برو که از وی در پزشکی داناتر است. اما پس از آن چنین گفت: استغفرالله، شک ندارم که غیبتش را کردم!
ورع وی به حدی بود که وقتی شنید کسی “حجاج بن یوسف ثقفی” را پس از مرگش بد میگوید به وی گفت: دست بردار ای پسر برادرم، زیرا که حجاج به سوی پروردگارش رفته است و تو هنگامی که به سوی پروردگار بروی خواهی دید که کوچکترین گناهی که در دنیا مرتکب شدهای برایت از بزرگترین گناهی که حجاج مرتکب شده سختتر خواهد بود… و بدان ای پسر برادرم که خداوند متعال همانطور که از حجاج برای کسانی که به آنها ستم کرده است قصاص خواهد نمود همانطور نیز برای وی از کسانی که به او ستم کردهاند قصاص خواهد گرفت، پس از این به بعد خود را مشغول ناسزا گفتن به کسی مکن.